Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3C1V9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3C1V9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Q3C1V9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q3C1V9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q3C1V9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3C1V9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3C1V9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3C1V9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3C1V9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3C1V9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3C1V9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3C1V9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3C1V9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Q3C1V9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3C1V9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3C1V9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3C1V9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3C1V9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3C1V9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3C1V9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3C1V9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3C1V9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3C1V9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3C1V9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3C1V9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3C1V9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3C1V9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3C1V9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3C1V9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3C1V9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q3C1V9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q3C1V9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q3C1V9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3C1V9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3C1V9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3C1V9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3C1V9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3C1V9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3C1V9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3C1V9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3C1V9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3C1V9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3C1V9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3C1V9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3C1V9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3C1V9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3C1V9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3C1V9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3C1V9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3C1V9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3C1V9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3C1V9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3C1V9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3C1V9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3C1V9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3C1V9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3C1V9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3C1V9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3C1V9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3C1V9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3C1V9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3C1V9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3C1V9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3C1V9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3C1V9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3C1V9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3C1V9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3C1V9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3C1V9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3C1V9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3C1V9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3C1V9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3C1V9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3C1V9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3C1V9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3C1V9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3C1V9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3C1V9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3C1V9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3C1V9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3C1V9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3C1V9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3C1V9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3C1V9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3C1V9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q3C1V9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q3C1V9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q3C1V9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q3C1V9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Q3C1V9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q3C1V9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q3C1V9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q3C1V9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q3C1V9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Q3C1V9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q3C1V9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Q3C1V9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Q3C1V9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Q3C1V9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms