Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNOP1Q1ED39 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KNOP1Q1ED39 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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