Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN21Q16825 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN21Q16825 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
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