Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFA9Q16795 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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