Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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