Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNASE1L3Q13609 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNASE1L3Q13609 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNASE1L3Q13609 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE1L3Q13609 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms