Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTA1Q13424 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTA1Q13424 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNTA1Q13424 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNTA1Q13424 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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