Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
SEMA3BQ13214 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA3BQ13214 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3BQ13214 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3BQ13214 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
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