Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYCNQ0VAF6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms