Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPIRE1Q08AE8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPIRE1Q08AE8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPIRE1Q08AE8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms