Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP1Q07960 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARHGAP1Q07960 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP1Q07960 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms