Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RING1Q06587 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RING1Q06587 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RING1Q06587 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RING1Q06587 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RING1Q06587 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RING1Q06587 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RING1Q06587 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RING1Q06587 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RING1Q06587 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RING1Q06587 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RING1Q06587 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RING1Q06587 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RING1Q06587 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RING1Q06587 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RING1Q06587 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RING1Q06587 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RING1Q06587 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RING1Q06587 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RING1Q06587 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RING1Q06587 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RING1Q06587 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RING1Q06587 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RING1Q06587 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RING1Q06587 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RING1Q06587 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RING1Q06587 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RING1Q06587 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RING1Q06587 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RING1Q06587 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RING1Q06587 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RING1Q06587 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RING1Q06587 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RING1Q06587 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RING1Q06587 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RING1Q06587 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RING1Q06587 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RING1Q06587 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RING1Q06587 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RING1Q06587 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RING1Q06587 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RING1Q06587 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RING1Q06587 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RING1Q06587 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RING1Q06587 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RING1Q06587 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RING1Q06587 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RING1Q06587 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RING1Q06587 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RING1Q06587 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RING1Q06587 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RING1Q06587 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RING1Q06587 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RING1Q06587 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RING1Q06587 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RING1Q06587 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RING1Q06587 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RING1Q06587 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RING1Q06587 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RING1Q06587 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RING1Q06587 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RING1Q06587 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RING1Q06587 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RING1Q06587 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RING1Q06587 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RING1Q06587 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RING1Q06587 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RING1Q06587 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RING1Q06587 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RING1Q06587 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RING1Q06587 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RING1Q06587 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RING1Q06587 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RING1Q06587 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RING1Q06587 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RING1Q06587 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RING1Q06587 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RING1Q06587 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RING1Q06587 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RING1Q06587 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RING1Q06587 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RING1Q06587 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RING1Q06587 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RING1Q06587 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RING1Q06587 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RING1Q06587 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RING1Q06587 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RING1Q06587 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RING1Q06587 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RING1Q06587 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RING1Q06587 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RING1Q06587 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RING1Q06587 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RING1Q06587 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RING1Q06587 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RING1Q06587 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RING1Q06587 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RING1Q06587 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RING1Q06587 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RING1Q06587 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms