Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN1Q05586 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GRIN1Q05586 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN1Q05586 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN1Q05586 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms