Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
CYP4A11Q02928 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP4A11Q02928 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP4A11Q02928 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP4A11Q02928 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms