Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC6A3Q01959 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC6A3Q01959 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms