Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1DQ01668 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA1DQ01668 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1DQ01668 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1DQ01668 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms