Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MAT1AQ00266 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms