Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3AP98173 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3AP98173 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms