Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMAD3P84022 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD3P84022 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD3P84022 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD3P84022 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms