Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RBP5P82980 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RBP5P82980 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBP5P82980 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBP5P82980 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBP5P82980 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBP5P82980 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBP5P82980 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RBP5P82980 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBP5P82980 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBP5P82980 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBP5P82980 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBP5P82980 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBP5P82980 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBP5P82980 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBP5P82980 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBP5P82980 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBP5P82980 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBP5P82980 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBP5P82980 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RBP5P82980 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBP5P82980 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBP5P82980 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBP5P82980 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBP5P82980 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBP5P82980 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBP5P82980 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBP5P82980 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBP5P82980 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBP5P82980 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBP5P82980 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBP5P82980 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBP5P82980 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBP5P82980 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBP5P82980 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBP5P82980 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBP5P82980 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBP5P82980 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBP5P82980 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBP5P82980 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBP5P82980 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBP5P82980 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBP5P82980 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBP5P82980 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBP5P82980 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBP5P82980 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBP5P82980 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBP5P82980 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBP5P82980 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RBP5P82980 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBP5P82980 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBP5P82980 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBP5P82980 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBP5P82980 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RBP5P82980 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBP5P82980 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBP5P82980 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBP5P82980 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBP5P82980 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBP5P82980 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBP5P82980 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RBP5P82980 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RBP5P82980 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBP5P82980 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RBP5P82980 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RBP5P82980 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBP5P82980 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBP5P82980 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBP5P82980 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBP5P82980 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBP5P82980 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBP5P82980 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBP5P82980 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RBP5P82980 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBP5P82980 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBP5P82980 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RBP5P82980 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBP5P82980 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBP5P82980 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBP5P82980 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBP5P82980 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBP5P82980 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBP5P82980 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBP5P82980 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBP5P82980 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBP5P82980 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RBP5P82980 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBP5P82980 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBP5P82980 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBP5P82980 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBP5P82980 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBP5P82980 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBP5P82980 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBP5P82980 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBP5P82980 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBP5P82980 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBP5P82980 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms