Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ASIC1P78348 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC1P78348 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ASIC1P78348 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ASIC1P78348 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ASIC1P78348 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms