Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTG1P63261 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTG1P63261 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTG1P63261 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.2 ms