Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SUMO1P63165 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms