Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS28P62857 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS28P62857 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS28P62857 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS28P62857 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS28P62857 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS28P62857 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS28P62857 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS28P62857 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPS28P62857 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS28P62857 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS28P62857 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS28P62857 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS28P62857 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS28P62857 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPS28P62857 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPS28P62857 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPS28P62857 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPS28P62857 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPS28P62857 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPS28P62857 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS28P62857 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS28P62857 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS28P62857 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS28P62857 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS28P62857 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS28P62857 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS28P62857 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS28P62857 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS28P62857 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS28P62857 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS28P62857 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS28P62857 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS28P62857 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS28P62857 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS28P62857 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS28P62857 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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