Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAP1AP62834 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAP1AP62834 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAP1AP62834 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAP1AP62834 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAP1AP62834 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAP1AP62834 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAP1AP62834 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAP1AP62834 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms