Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS13P62277 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS13P62277 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS13P62277 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS13P62277 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS13P62277 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS13P62277 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS13P62277 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS13P62277 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS13P62277 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS13P62277 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS13P62277 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS13P62277 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS13P62277 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS13P62277 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS13P62277 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS13P62277 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS13P62277 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS13P62277 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS13P62277 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS13P62277 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS13P62277 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS13P62277 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS13P62277 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS13P62277 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS13P62277 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS13P62277 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS13P62277 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS13P62277 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS13P62277 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS13P62277 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS13P62277 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS13P62277 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS13P62277 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS13P62277 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS13P62277 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS13P62277 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS13P62277 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS13P62277 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS13P62277 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS13P62277 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS13P62277 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS13P62277 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS13P62277 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS13P62277 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS13P62277 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS13P62277 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS13P62277 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS13P62277 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS13P62277 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS13P62277 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS13P62277 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS13P62277 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS13P62277 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS13P62277 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS13P62277 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS13P62277 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS13P62277 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS13P62277 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS13P62277 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS13P62277 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS13P62277 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS13P62277 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS13P62277 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS13P62277 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS13P62277 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS13P62277 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS13P62277 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms