Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCS1P62166 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCS1P62166 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCS1P62166 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCS1P62166 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCS1P62166 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCS1P62166 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCS1P62166 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCS1P62166 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCS1P62166 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCS1P62166 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCS1P62166 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCS1P62166 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCS1P62166 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCS1P62166 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCS1P62166 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCS1P62166 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCS1P62166 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCS1P62166 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCS1P62166 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCS1P62166 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCS1P62166 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCS1P62166 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCS1P62166 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCS1P62166 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCS1P62166 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCS1P62166 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCS1P62166 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCS1P62166 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCS1P62166 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCS1P62166 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCS1P62166 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCS1P62166 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCS1P62166 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCS1P62166 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCS1P62166 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCS1P62166 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCS1P62166 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCS1P62166 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCS1P62166 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCS1P62166 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCS1P62166 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCS1P62166 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCS1P62166 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCS1P62166 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCS1P62166 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCS1P62166 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCS1P62166 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCS1P62166 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCS1P62166 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCS1P62166 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCS1P62166 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCS1P62166 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCS1P62166 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NCS1P62166 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCS1P62166 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCS1P62166 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCS1P62166 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCS1P62166 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCS1P62166 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCS1P62166 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCS1P62166 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCS1P62166 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCS1P62166 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCS1P62166 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCS1P62166 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCS1P62166 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCS1P62166 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCS1P62166 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCS1P62166 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCS1P62166 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCS1P62166 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCS1P62166 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCS1P62166 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCS1P62166 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCS1P62166 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCS1P62166 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCS1P62166 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCS1P62166 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCS1P62166 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCS1P62166 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCS1P62166 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCS1P62166 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCS1P62166 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCS1P62166 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCS1P62166 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCS1P62166 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCS1P62166 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCS1P62166 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCS1P62166 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCS1P62166 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCS1P62166 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCS1P62166 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCS1P62166 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCS1P62166 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCS1P62166 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCS1P62166 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCS1P62166 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCS1P62166 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCS1P62166 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms