Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVFC1-1P60608 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1-1P60608 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms