Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LOXL3P58215 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL3P58215 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms