Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSCP53634 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSCP53634 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSCP53634 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSCP53634 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSCP53634 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSCP53634 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSCP53634 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSCP53634 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSCP53634 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSCP53634 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSCP53634 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSCP53634 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSCP53634 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSCP53634 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSCP53634 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSCP53634 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSCP53634 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSCP53634 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSCP53634 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSCP53634 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSCP53634 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTSCP53634 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSCP53634 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSCP53634 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSCP53634 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSCP53634 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSCP53634 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSCP53634 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSCP53634 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSCP53634 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSCP53634 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSCP53634 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSCP53634 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSCP53634 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSCP53634 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSCP53634 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSCP53634 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSCP53634 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSCP53634 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSCP53634 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSCP53634 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSCP53634 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSCP53634 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSCP53634 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSCP53634 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSCP53634 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSCP53634 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSCP53634 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSCP53634 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSCP53634 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSCP53634 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSCP53634 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSCP53634 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSCP53634 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSCP53634 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSCP53634 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSCP53634 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSCP53634 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSCP53634 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSCP53634 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSCP53634 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSCP53634 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSCP53634 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSCP53634 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSCP53634 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSCP53634 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSCP53634 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSCP53634 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSCP53634 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSCP53634 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSCP53634 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSCP53634 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSCP53634 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSCP53634 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSCP53634 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSCP53634 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSCP53634 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSCP53634 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSCP53634 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSCP53634 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSCP53634 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSCP53634 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSCP53634 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSCP53634 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSCP53634 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSCP53634 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSCP53634 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSCP53634 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSCP53634 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms