Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THOP1P52888 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THOP1P52888 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THOP1P52888 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THOP1P52888 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THOP1P52888 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THOP1P52888 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
THOP1P52888 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
THOP1P52888 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THOP1P52888 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THOP1P52888 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THOP1P52888 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THOP1P52888 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THOP1P52888 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THOP1P52888 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THOP1P52888 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THOP1P52888 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THOP1P52888 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THOP1P52888 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THOP1P52888 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THOP1P52888 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THOP1P52888 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THOP1P52888 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THOP1P52888 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THOP1P52888 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THOP1P52888 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THOP1P52888 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THOP1P52888 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THOP1P52888 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THOP1P52888 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THOP1P52888 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THOP1P52888 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THOP1P52888 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THOP1P52888 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THOP1P52888 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THOP1P52888 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THOP1P52888 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THOP1P52888 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THOP1P52888 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THOP1P52888 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THOP1P52888 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THOP1P52888 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THOP1P52888 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THOP1P52888 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THOP1P52888 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THOP1P52888 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THOP1P52888 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THOP1P52888 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THOP1P52888 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THOP1P52888 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THOP1P52888 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THOP1P52888 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THOP1P52888 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THOP1P52888 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THOP1P52888 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THOP1P52888 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THOP1P52888 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THOP1P52888 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THOP1P52888 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THOP1P52888 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THOP1P52888 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THOP1P52888 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THOP1P52888 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THOP1P52888 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THOP1P52888 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THOP1P52888 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THOP1P52888 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THOP1P52888 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THOP1P52888 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THOP1P52888 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THOP1P52888 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
THOP1P52888 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THOP1P52888 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THOP1P52888 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THOP1P52888 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
THOP1P52888 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THOP1P52888 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THOP1P52888 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THOP1P52888 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THOP1P52888 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THOP1P52888 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THOP1P52888 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THOP1P52888 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THOP1P52888 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THOP1P52888 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THOP1P52888 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
THOP1P52888 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
THOP1P52888 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THOP1P52888 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms