Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2E1P51965 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E1P51965 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E1P51965 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms