Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX5P50542 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX5P50542 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX5P50542 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX5P50542 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX5P50542 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX5P50542 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX5P50542 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX5P50542 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX5P50542 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX5P50542 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX5P50542 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX5P50542 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX5P50542 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX5P50542 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX5P50542 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX5P50542 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX5P50542 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX5P50542 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX5P50542 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX5P50542 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX5P50542 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX5P50542 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX5P50542 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX5P50542 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX5P50542 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX5P50542 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX5P50542 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX5P50542 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX5P50542 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX5P50542 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX5P50542 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX5P50542 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX5P50542 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX5P50542 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX5P50542 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PEX5P50542 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PEX5P50542 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX5P50542 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX5P50542 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX5P50542 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX5P50542 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX5P50542 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX5P50542 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX5P50542 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX5P50542 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX5P50542 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX5P50542 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX5P50542 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX5P50542 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX5P50542 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX5P50542 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX5P50542 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX5P50542 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX5P50542 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX5P50542 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX5P50542 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX5P50542 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX5P50542 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX5P50542 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX5P50542 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PEX5P50542 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX5P50542 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX5P50542 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX5P50542 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX5P50542 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX5P50542 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX5P50542 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX5P50542 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX5P50542 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX5P50542 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX5P50542 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX5P50542 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX5P50542 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX5P50542 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX5P50542 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX5P50542 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX5P50542 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX5P50542 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX5P50542 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX5P50542 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX5P50542 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX5P50542 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX5P50542 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX5P50542 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX5P50542 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX5P50542 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX5P50542 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX5P50542 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX5P50542 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX5P50542 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms