Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GATMP50440 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GATMP50440 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GATMP50440 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GATMP50440 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GATMP50440 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GATMP50440 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GATMP50440 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GATMP50440 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATMP50440 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATMP50440 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATMP50440 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATMP50440 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATMP50440 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATMP50440 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GATMP50440 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GATMP50440 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GATMP50440 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GATMP50440 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GATMP50440 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GATMP50440 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GATMP50440 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
GATMP50440 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GATMP50440 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GATMP50440 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GATMP50440 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GATMP50440 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GATMP50440 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GATMP50440 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATMP50440 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATMP50440 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATMP50440 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GATMP50440 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GATMP50440 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GATMP50440 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATMP50440 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATMP50440 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATMP50440 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATMP50440 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATMP50440 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATMP50440 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATMP50440 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATMP50440 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATMP50440 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GATMP50440 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATMP50440 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATMP50440 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATMP50440 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATMP50440 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GATMP50440 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GATMP50440 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GATMP50440 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GATMP50440 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GATMP50440 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GATMP50440 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GATMP50440 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GATMP50440 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GATMP50440 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GATMP50440 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GATMP50440 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GATMP50440 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GATMP50440 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GATMP50440 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GATMP50440 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GATMP50440 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATMP50440 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATMP50440 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATMP50440 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATMP50440 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATMP50440 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATMP50440 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATMP50440 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GATMP50440 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GATMP50440 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GATMP50440 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GATMP50440 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATMP50440 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATMP50440 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATMP50440 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATMP50440 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATMP50440 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GATMP50440 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATMP50440 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GATMP50440 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GATMP50440 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GATMP50440 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GATMP50440 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GATMP50440 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GATMP50440 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms