Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PSMB3P49720 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB3P49720 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB3P49720 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms