Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POU3F4P49335 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POU3F4P49335 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
POU3F4P49335 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU3F4P49335 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU3F4P49335 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU3F4P49335 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POU3F4P49335 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms