Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA8P48165 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA8P48165 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA8P48165 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA8P48165 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA8P48165 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA8P48165 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA8P48165 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA8P48165 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA8P48165 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA8P48165 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA8P48165 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA8P48165 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA8P48165 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA8P48165 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA8P48165 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA8P48165 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA8P48165 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA8P48165 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA8P48165 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA8P48165 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA8P48165 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA8P48165 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA8P48165 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA8P48165 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA8P48165 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA8P48165 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA8P48165 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA8P48165 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA8P48165 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA8P48165 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA8P48165 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA8P48165 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA8P48165 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA8P48165 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA8P48165 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA8P48165 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA8P48165 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA8P48165 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA8P48165 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA8P48165 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA8P48165 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA8P48165 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA8P48165 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA8P48165 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA8P48165 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA8P48165 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA8P48165 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA8P48165 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA8P48165 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA8P48165 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA8P48165 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA8P48165 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA8P48165 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA8P48165 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA8P48165 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA8P48165 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA8P48165 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA8P48165 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA8P48165 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA8P48165 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA8P48165 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA8P48165 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA8P48165 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA8P48165 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJA8P48165 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJA8P48165 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA8P48165 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA8P48165 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA8P48165 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA8P48165 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA8P48165 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA8P48165 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA8P48165 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA8P48165 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA8P48165 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA8P48165 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA8P48165 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA8P48165 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA8P48165 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA8P48165 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA8P48165 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA8P48165 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA8P48165 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA8P48165 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA8P48165 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA8P48165 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA8P48165 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA8P48165 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA8P48165 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA8P48165 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA8P48165 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA8P48165 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA8P48165 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA8P48165 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA8P48165 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA8P48165 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA8P48165 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA8P48165 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA8P48165 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms