Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAP2K4P45985 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP2K4P45985 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms