Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDAP32320 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDAP32320 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDAP32320 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDAP32320 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDAP32320 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDAP32320 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDAP32320 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDAP32320 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDAP32320 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDAP32320 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDAP32320 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDAP32320 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDAP32320 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDAP32320 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDAP32320 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDAP32320 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDAP32320 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDAP32320 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDAP32320 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDAP32320 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDAP32320 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDAP32320 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDAP32320 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDAP32320 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDAP32320 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDAP32320 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDAP32320 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDAP32320 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDAP32320 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDAP32320 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDAP32320 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDAP32320 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDAP32320 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDAP32320 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDAP32320 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDAP32320 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDAP32320 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDAP32320 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDAP32320 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDAP32320 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDAP32320 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDAP32320 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDAP32320 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDAP32320 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDAP32320 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDAP32320 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDAP32320 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDAP32320 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDAP32320 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDAP32320 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDAP32320 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDAP32320 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDAP32320 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDAP32320 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDAP32320 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDAP32320 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDAP32320 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDAP32320 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDAP32320 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDAP32320 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDAP32320 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDAP32320 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDAP32320 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDAP32320 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDAP32320 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDAP32320 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDAP32320 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDAP32320 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CDAP32320 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDAP32320 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDAP32320 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDAP32320 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDAP32320 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDAP32320 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDAP32320 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDAP32320 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDAP32320 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms