Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5DP30049 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5DP30049 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5DP30049 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5DP30049 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms