Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMLP29590 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMLP29590 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMLP29590 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMLP29590 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMLP29590 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMLP29590 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMLP29590 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMLP29590 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMLP29590 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PMLP29590 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMLP29590 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMLP29590 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMLP29590 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMLP29590 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMLP29590 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMLP29590 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMLP29590 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PMLP29590 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMLP29590 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMLP29590 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMLP29590 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMLP29590 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMLP29590 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMLP29590 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMLP29590 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMLP29590 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMLP29590 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMLP29590 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMLP29590 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMLP29590 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMLP29590 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMLP29590 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMLP29590 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMLP29590 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMLP29590 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMLP29590 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMLP29590 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMLP29590 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMLP29590 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PMLP29590 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMLP29590 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMLP29590 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMLP29590 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMLP29590 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMLP29590 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMLP29590 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMLP29590 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMLP29590 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMLP29590 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMLP29590 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMLP29590 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMLP29590 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMLP29590 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMLP29590 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMLP29590 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMLP29590 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMLP29590 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMLP29590 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMLP29590 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMLP29590 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMLP29590 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMLP29590 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMLP29590 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMLP29590 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMLP29590 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMLP29590 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMLP29590 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMLP29590 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMLP29590 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMLP29590 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMLP29590 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMLP29590 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMLP29590 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMLP29590 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMLP29590 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMLP29590 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMLP29590 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMLP29590 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMLP29590 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMLP29590 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMLP29590 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PMLP29590 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMLP29590 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMLP29590 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMLP29590 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMLP29590 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMLP29590 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMLP29590 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMLP29590 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PMLP29590 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms