Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRMP28827 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRMP28827 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PTPRMP28827 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PTPRMP28827 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRMP28827 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
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