Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX2P28328 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX2P28328 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX2P28328 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX2P28328 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX2P28328 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX2P28328 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX2P28328 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX2P28328 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX2P28328 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX2P28328 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX2P28328 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX2P28328 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX2P28328 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX2P28328 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX2P28328 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX2P28328 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX2P28328 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX2P28328 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX2P28328 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX2P28328 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX2P28328 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX2P28328 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX2P28328 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX2P28328 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX2P28328 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX2P28328 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX2P28328 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX2P28328 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX2P28328 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX2P28328 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX2P28328 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX2P28328 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX2P28328 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX2P28328 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX2P28328 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX2P28328 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX2P28328 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX2P28328 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX2P28328 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX2P28328 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX2P28328 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX2P28328 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX2P28328 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX2P28328 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX2P28328 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX2P28328 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX2P28328 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX2P28328 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX2P28328 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX2P28328 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX2P28328 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX2P28328 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX2P28328 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX2P28328 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX2P28328 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX2P28328 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX2P28328 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX2P28328 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX2P28328 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX2P28328 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX2P28328 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX2P28328 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX2P28328 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX2P28328 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX2P28328 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX2P28328 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX2P28328 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX2P28328 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX2P28328 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX2P28328 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX2P28328 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX2P28328 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX2P28328 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX2P28328 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX2P28328 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX2P28328 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX2P28328 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX2P28328 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX2P28328 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX2P28328 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX2P28328 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX2P28328 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX2P28328 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX2P28328 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX2P28328 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX2P28328 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX2P28328 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX2P28328 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX2P28328 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX2P28328 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX2P28328 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX2P28328 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX2P28328 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX2P28328 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX2P28328 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX2P28328 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX2P28328 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX2P28328 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX2P28328 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms