Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMO2P25791 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMO2P25791 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMO2P25791 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMO2P25791 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMO2P25791 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMO2P25791 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMO2P25791 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMO2P25791 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMO2P25791 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMO2P25791 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMO2P25791 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMO2P25791 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMO2P25791 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMO2P25791 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMO2P25791 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMO2P25791 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMO2P25791 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMO2P25791 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMO2P25791 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMO2P25791 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LMO2P25791 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMO2P25791 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMO2P25791 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMO2P25791 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMO2P25791 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMO2P25791 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMO2P25791 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMO2P25791 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMO2P25791 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMO2P25791 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMO2P25791 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO2P25791 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO2P25791 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO2P25791 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO2P25791 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO2P25791 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO2P25791 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO2P25791 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO2P25791 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO2P25791 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO2P25791 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO2P25791 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO2P25791 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO2P25791 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO2P25791 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO2P25791 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO2P25791 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO2P25791 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO2P25791 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO2P25791 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO2P25791 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO2P25791 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO2P25791 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO2P25791 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO2P25791 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO2P25791 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO2P25791 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO2P25791 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO2P25791 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO2P25791 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO2P25791 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO2P25791 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO2P25791 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO2P25791 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO2P25791 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO2P25791 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO2P25791 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO2P25791 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO2P25791 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO2P25791 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO2P25791 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO2P25791 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO2P25791 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO2P25791 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO2P25791 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO2P25791 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO2P25791 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO2P25791 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO2P25791 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO2P25791 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO2P25791 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO2P25791 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO2P25791 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO2P25791 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO2P25791 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO2P25791 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO2P25791 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO2P25791 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO2P25791 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO2P25791 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms