Protein–RNA interactions for Protein: P25685

DNAJB1, DnaJ homolog subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB1P25685 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJB1P25685 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJB1P25685 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJB1P25685 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB1P25685 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms