Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PTPRGP23470 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PTPRGP23470 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PTPRGP23470 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PTPRGP23470 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PTPRGP23470 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173 ms