Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF3P20783 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF3P20783 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF3P20783 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF3P20783 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF3P20783 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF3P20783 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF3P20783 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF3P20783 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF3P20783 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF3P20783 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF3P20783 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF3P20783 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF3P20783 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF3P20783 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF3P20783 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF3P20783 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF3P20783 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF3P20783 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF3P20783 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF3P20783 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF3P20783 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF3P20783 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF3P20783 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF3P20783 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF3P20783 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF3P20783 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF3P20783 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF3P20783 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF3P20783 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF3P20783 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF3P20783 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF3P20783 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTF3P20783 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTF3P20783 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTF3P20783 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTF3P20783 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NTF3P20783 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NTF3P20783 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NTF3P20783 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTF3P20783 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTF3P20783 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTF3P20783 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTF3P20783 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTF3P20783 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTF3P20783 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTF3P20783 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NTF3P20783 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTF3P20783 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTF3P20783 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTF3P20783 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTF3P20783 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTF3P20783 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTF3P20783 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTF3P20783 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTF3P20783 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTF3P20783 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTF3P20783 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTF3P20783 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTF3P20783 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTF3P20783 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTF3P20783 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTF3P20783 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTF3P20783 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms