Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD46P15529 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD46P15529 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD46P15529 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD46P15529 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD46P15529 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD46P15529 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD46P15529 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD46P15529 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD46P15529 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD46P15529 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD46P15529 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD46P15529 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD46P15529 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD46P15529 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD46P15529 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD46P15529 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD46P15529 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD46P15529 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD46P15529 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD46P15529 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD46P15529 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD46P15529 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD46P15529 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD46P15529 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD46P15529 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD46P15529 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD46P15529 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD46P15529 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD46P15529 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD46P15529 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD46P15529 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD46P15529 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD46P15529 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD46P15529 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD46P15529 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD46P15529 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD46P15529 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD46P15529 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD46P15529 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD46P15529 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD46P15529 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD46P15529 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD46P15529 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD46P15529 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD46P15529 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD46P15529 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD46P15529 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD46P15529 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD46P15529 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD46P15529 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD46P15529 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD46P15529 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD46P15529 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD46P15529 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD46P15529 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD46P15529 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD46P15529 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD46P15529 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD46P15529 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD46P15529 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD46P15529 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD46P15529 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD46P15529 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD46P15529 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD46P15529 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD46P15529 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD46P15529 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD46P15529 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD46P15529 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD46P15529 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD46P15529 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD46P15529 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD46P15529 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD46P15529 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD46P15529 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD46P15529 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD46P15529 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD46P15529 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD46P15529 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD46P15529 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD46P15529 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD46P15529 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD46P15529 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD46P15529 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD46P15529 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD46P15529 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD46P15529 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD46P15529 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD46P15529 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms