Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOLR1P15328 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOLR1P15328 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOLR1P15328 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms