Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBP11277 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBP11277 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBP11277 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBP11277 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBP11277 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBP11277 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBP11277 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBP11277 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBP11277 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBP11277 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBP11277 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBP11277 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBP11277 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBP11277 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTBP11277 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTBP11277 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTBP11277 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTBP11277 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTBP11277 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBP11277 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBP11277 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBP11277 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBP11277 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBP11277 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBP11277 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBP11277 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBP11277 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBP11277 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBP11277 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBP11277 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBP11277 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBP11277 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBP11277 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBP11277 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBP11277 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBP11277 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBP11277 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBP11277 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBP11277 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBP11277 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBP11277 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBP11277 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBP11277 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBP11277 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBP11277 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBP11277 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBP11277 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBP11277 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBP11277 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBP11277 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBP11277 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBP11277 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBP11277 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTBP11277 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBP11277 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBP11277 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBP11277 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBP11277 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBP11277 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBP11277 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBP11277 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBP11277 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBP11277 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBP11277 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBP11277 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBP11277 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBP11277 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBP11277 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBP11277 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBP11277 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBP11277 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBP11277 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBP11277 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTBP11277 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTBP11277 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTBP11277 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTBP11277 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTBP11277 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBP11277 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBP11277 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBP11277 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBP11277 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTBP11277 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTBP11277 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTBP11277 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTBP11277 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBP11277 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBP11277 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBP11277 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBP11277 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBP11277 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBP11277 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBP11277 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBP11277 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBP11277 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBP11277 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBP11277 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBP11277 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBP11277 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1721.4 ms